1. ทุนทั่วไป วิทยาเขตปัตตานี
2. ทุนกำหนดทิศทาง วิทยาเขตปัตตานี
3. ประชุมคณะกรรมการบริหารกองทุนวิจัยวิทยาเขตปัตตานี
4. ทุนภายนอก
5. สถานวิจัย/หน่วยวิจัยต่าง ๆ
6. ทุนวิจัยจากสถาบันวิจัยฮาลาล
7. แผนงานบูรณาการวิจัยและนวัตกรรม
8. อื่น ๆ ที่ได้รับมอบหมาย